在工業冷水機中，壓縮機質量的好壞決定著冷水機的工作效率是否優良，同時壓縮機在冷水機的今后售后維修中也占有很重要的位置，一旦出現故障，將會提高企業維修冷水機的費用提高。正常工作情況下，工業冷水機制冷壓縮機應該吸入制冷工質的干蒸氣，若是制冷工質流量大、熱負荷變化太快、操作不當都可能吸入濕蒸氣，或者液體工質，如果進入的液體太多，來不及從排氣閥排出，高壓形成的液擊會造成氣缸、氣閥、活塞、連桿等零件損壞。建議可采取的保護措施是安裝氣液分離器，使夾帶在低壓蒸氣中的液體分離出來，保證壓縮機的干行程；安裝油加熱器，在壓縮機起動前對潤滑油加入，降低溶在潤滑油中的制冷劑量；或將氣閥組件用一彈簧緊壓在氣缸端部，形成假蓋；

冷水機吸排氣壓力的控制：如果排氣壓力超過給定值，高壓控制部分切斷壓縮機電源，壓縮機停機；吸氣壓力低于給定值，低壓控制部分切斷壓縮機電源，使其停機，并發出報警信號。

安全閥：為防止制冷劑泄漏至大氣，一般采用閉式安全閥，安全閥設置在冷水機組壓縮機排氣腔和吸氣腔之間的管路上。

安全膜：冷水機安全膜片安裝在吸氣、排氣腔之間，吸排氣壓力差超過規定值時，膜片破裂，排氣壓力降低(需在吸氣腔側裝濾網，防止破碎膜片落入吸氣腔)。

潤滑油壓差控制器：冷水機把液壓泵入口與液壓泵出口分別和潤滑油壓差控制器上的低壓入口、高壓出口接通，當液壓泵出、入口之間的壓力差過高或過低時，控制器就會切斷壓縮機電源，電動機停止運轉，保護冷水機壓縮機。

冷水機內置電動機的保護，為更進一步確保電動機不過熱，除了正確使用，注意維修外，建議可以安裝過熱繼電器；冷水機常用的三相電動機缺相的話會導致電動機無法起動或過載，可采用過載繼電器避免電動機因缺相損壞。冷水機排氣溫度保護方法主要是將溫控器安放在靠近排氣口處，感應到排氣溫度過高時，溫控器動作切斷電路；冷水機引起機組的殼體溫度過高主要因為冷凝器的換熱能力不足，建議檢查冷凝器的風量或水量、水溫是否合適，或是制冷系統內混入空氣或其它不凝性氣體等等，需要仔細觀察并檢測。